- Aguas del Padre
- Ajuterique
- Cerro Blanco
- Comayagua
- Concepción de Guasistagua
- El Agua Dulcita
- El Porvenir
- El Rancho
- El Rincón
- El Rosario
- El Sauce
- El Socorro
- Esquías
- Flores
- Jamalteca
- La Libertad
- Lamaní
- Las Lajas
- Lejamaní
- Minas de Oro
- Ojos de Agua
- Potrerillos
- Río Bonito
- San Antonio de la Cuesta
- San Jerónimo
- San José de Comayagua
- San José del Potrero
- San Luis
- San Sebastián
- Siguatepeque
- Taulabé
- Valle de Ángeles
- Villa de San Antonio